Electroforesis de ADN: Conceptos Básicos
Electroforesis y su Utilidad en el Análisis de Ácidos Nucleicos
Definición y Principios Básicos
- La electroforesis se define como el movimiento de partículas bajo un campo eléctrico, utilizado para separar moléculas según su tamaño.
- En el caso del ADN, los grupos fosfato confieren una carga negativa a la molécula, lo que influye en su movilidad electroforética.
Tipos de Electroforesis
Electroforesis en Gel Agarosa
- Este método utiliza geles de agarosa para separar cadenas de ADN pequeñas (hasta kilobases) y se corre horizontalmente con botones de corrida como TAE o TVE.
Electroforesis en Gel de Poliacrilamida
- Principalmente utilizada para proteínas, también separa ácidos nucleicos más pequeños con mayor resolución; se forma mediante polimerización iniciada por amonio.
- Los geles son verticales para evitar contacto con oxígeno, lo que podría inhibir la polimerización.
Comparación y Análisis
- Se utilizan estándares con fragmentos conocidos para comparar las bandas obtenidas tras la separación electroforética. Esto es común en ensayos de genotipificación.
- El bromuro de etidio se usa para teñir el ADN, permitiendo visualizar las bandas bajo luz ultravioleta.
Métodos Avanzados
Electroforesis de Campos Pulsados
- Ideal para trabajar con fragmentos grandes (megabases), cambia el voltaje en tres direcciones diferentes, mejorando la definición de cadenas largas frente a cortas.
- Es útil en infectología al analizar patrones de restricción del genoma bacteriano y sus mutaciones.
Electroforesis en Gradiente Desnaturalizante
- Utiliza un gel con gradiente de urea y formamida que desnaturaliza cadenas de ADN; menos migración ocurre cuanto más desnaturalizada está una cadena.
- Permite observar mutaciones o genes únicos debido a cambios mínimos en la secuencia del ADN que afectan sus propiedades físico-químicas.
Electroforesis Capilar